Archivos de la categoría Ciencia

La valoración de estos veinte años

«La paradoja de Levinthal es un experimento mental en la teoría de la dinámica del plegamiento de proteínas.

En 1969, Cyrus Levinthal señaló que, debido al gran número de grados de libertad en una cadena polipeptídica desplegada, la molécula tiene un número astronómico de posibles conformaciones. La estimación es de 3^300 o 10^143 en una de sus publicaciones. Si una proteína llegara a alcanzar la configuración de plegamiento correcto adoptando al azar todas las configuraciones posibles necesitaría de un tiempo mayor a la edad del universo para alcanzar a la conformación correcta. Esto es así incluso si las conformaciones son probadas a velocidades muy elevadas del orden de nanosegundos o picosegundos.

Funnel energy protein folding levinthal plegamiento proteinas energia

La paradoja sin embargo es que la mayoría de las proteínas se pliegan de forma espontánea en un tiempo de milisegundos o microsegundos. […]

Levinthal era consciente de que las proteínas se plegaban de forma espontánea y en muy poco tiempo, y que una búsqueda aleatoria de la conformación, era imposible […].»

Paradoja de Levinthal

Imagen: Complejidad algorítmica del plegamiento.

Un acto de creación

«Volviendo al asunto del ritornelo -este tipo de repetición de un cierto sonido que se presenta como factor de creación atmosférica en un espacio y un tiempo determinados-, su cualidad sonora le otorgaría ventaja sobre otro tipo de percepciones sensoriales.

La importancia de pensar que todo en el universo funciona dentro de una mecánica de movimiento, la cual genera ciertos zumbidos característicos para la materia […]; es innegable pensar así en la Naturaleza como música, ya que todo está sonando todo el tiempo. Ahora bien, según Deleuze la autonomía de la naturaleza es puro caos, pero a través de los sonidos se genera un cierto orden en las cosas. Esto daría pie a la postura respecto al trabajo del ritornelo como proceso de territorialización. […]

Mucho mejor a pantalla completa.

El sonido se apropia de las circunstancias, crea un cierto ambiente, le da un espacio y un tiempo específicos al acontecimiento percibido; así se crearía entonces una especie de determinación momentánea capaz de clarificar el desorden hacia un devenir delimitado […].

Cada vez que se presenta un ritornelo, se genera a la par un fenómeno de apropiación del espacio y el tiempo por parte de este sonido que sumerge todo lo que está ocurriendo dentro de una cierta mecánica ordenada […].»

Lenguaje, sonido y espacio. Inquietudes surgidas de una experiencia en el Museo

«Born Jorge Seva in 1979, “Alex Roman” is an artistic alias for publishing commercial work. He has been working for several companies since until he raised a brand new company by hiself: “The Third & The Seventh S.L.”

After that, he took a sabbatical year for to work on a short animated piece: “The Third & The Seventh”. He won a Cannes Film Craft Gold Lion in the year 2011 for the Silestone brand commercial: “Above everything else”»

Entrevista a Alex Roman en evermotion.org.

Milwaukee wisconsin santiago calatrava museum architecture

Imagen: Museo de arte moderno de Milwaukee, de Santiago Calatrava.

«—Con cierta frecuencia incluyes vegetación en tus creaciones, ¿qué sistema sigues para generarla?.

—En este caso era muy importante para mí que la vegetación tuviera “vida”, de modo que tenía que introducir viento en todos sus elementos. Empecé a experimentar el sistema de viento de OnyxTree pero no era muy eficaz en términos de memoria ni rendimiento, así que terminé por desarrollar un sistema propio que me permitiera generar cientos de árboles muy detallados con distintos patrones de viento a la vez y en la misma escena. Por ello, tuve que modelar y animar casi todo manualmente, una locura.»

Entrevista en CICE.

El trabajo tiene ya unos 4 años. Gracias Julio por enseñármelo.

Michael Nyman, The Departure.

Alexei Ananenko, Valeriy Bezpalov y Boris Baranov

«Se dice que salvaron a Europa o al menos a algún que otro millón de personas en miles de kilómetros a la redonda un frío día de abril.

Fueron a la muerte conscientemente, deliberadamente, para que los demás pudiésemos vivir. Cuando alguien piense que este género humano nuestro no tiene salvación, siempre puede recordar a hombres como estos y otros cientos o miles por el estilo que también estuvieron por allí. No circulan fotos de ellos, ni han hecho superproducciones de Hollywood, y hasta sus nombres son difíciles de encontrar.

Pero hoy, veinticuatro años después, yo brindo en su recuerdo, me cuadro ante su memoria y les doy mil veces las gracias. Por ir. »

Los tres superhéroes de Chernóbyl. Espectacular, en La pizarra de Yuri.

Liquidator medal, Chernobyl, Christopher Allen

Chernobyl Liquidator Medal, © Christopher Allen.

Trayectorias

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«Hasta que no ves que de verdad Júpiter tiene 2 franjas y 4 lunas en perfecta línea recta, y que, poco a poco, a lo largo de la noche, va recorriendo en el cielo la misma curva que ha recorrido el sol durante el día, no empiezas a pensar que, de verdad, tal y como toda la vida te han contado, los planetas giran alrededor del sol, que todos giran sobre sí mismos, que esas cuatro lunas están girando en torno a Júpiter, que todo gira alrededor de algo y de sí mismo; que todo trata de girar.»

Eclíptica 2. Primera observación. Santiago Latorre.

Cambiar la forma esperada para las respuestas

«En cierta forma, la complejidad, tal como la entendemos y vivimos, no es más que un reflejo de nuestras propias limitaciones. La poesía es capaz de soslayarlas y dejarnos entrever el mundo maravilloso que existe más allá de nuestros límites racionales […]. Cambiando las referencias de partida las preguntas más complejas se convierten en respuestas obvias

Fragmento, La Bella Teoría

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«Para Dirac, Dios debía ser un gran matemático y con las matemáticas que conocemos nos acercamos a conocer un trocito de su creación. Curiosamente, Dirac era un gran ateo. Al respecto, Pauli escribió bromeando en sus memorias: “Si entiendo correctamente a Dirac, él dice: no hay Dios, y Dirac es su profeta”.»

Fragmento, Dios, Hawking, los físicos y la metafísica.

La imagen se corresponde con el disco Silencio: Pärt, Glass & Martynov.

Partículas que saltan dentro y fuera de la «existencia»

«No se puede tener primero espacio y después cosas para poner en él, del mismo modo que no se puede tener primero una sonrisa y luego un gato de Cheshire en donde ésta encaje.»

Alfred North Whitehead

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«He refutes the idea that space is merely an empty arena where physical events take place. Instead, it views the “geometry” of space as the actual source of all physical structure. “Geometry bent one way here describes gravitation. Rippled another way somewhere else it manifests all the qualities of an electromagnetic wave. Excited at still another place, the magic material that is space shows itself as a particle. There is nothing that is foreign and “physical” immersed in space. Everything that is, is constructed out of geometry.”»

Fragmento, Second International Symposium on Non-Conventional Energy Technology

Max Richter: Memoryhouse

«La creación virtual de partícula y antipartícula significa que una partícula real está atada físicamente al campo (al entorno) y que nunca puede ser considerada como una entidad separada.

Mientras que en los campos clásicos de la gravitación y del electromagnetismo se piensa que una región del espacio tiene propiedades especiales que influencian el movimiento del cuerpo de prueba, y hablamos de la fuerza que un cuerpo experimenta y de su energía potencial en cada punto del campo —identificando necesariamente la fuente del mismo—, en los campos cuánticos es diferente. Independientemente de la fuente, los campos se encuentran presentes por todas partes. Se manifiestan en la creación y aniquilación de partículas elementales, tanto reales como virtuales.

Una partícula se ha de considerar teóricamente como una excitación del campo y, de ninguna manera, independiente de él

Fragmento, La imposible soledad de las partículas.

«La música comienza donde el habla es incapaz de expresar; la música está hecha para lo inexpresable».

Debussy

Umbral: al orden a través de las fluctuaciones

«Las estructuras disipativas constituyen la aparición de estructuras en sistemas alejados del equilibrio; estructuras que sólo pueden existir en conjunción con su entorno.

El término estructura disipativa busca representar la asociación de las ideas de orden y de disipación. El hecho fundamental es que la disipación de energía y de materia, que suele asociarse a la noción de pérdida y evolución hacia el desorden [nota: desorden=homogeneidad], se convierte, lejos del equilibrio, en fuente de orden

Adaptación.

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«Un notable ejemplo de estructura disipativa es el de un recipiente con líquido calentado uniformemente. […] Conforme se intensifica el calor, y a un determinado gradiente de temperatura bien definido, comienzan a aparecer “espontáneamente” células de convección de estructura muy regular. Ésto corresponde a un alto nivel de organización molecular en el que la energía ya se transfiere mediante corrientes de convección macroscópicas y no sólo por agitación térmica. […]

Podemos imaginar que siempre hay pequeñas corrientes de convección que surgen como fluctuaciones sobre el “estado promedio”, pero estas fluctuaciones se amortiguan y desaparecen por debajo de un determinado valor crítico del gradiente de temperatura.

Por encima del punto crítico, ciertas fluctuaciones se amplifican y dan lugar a una corriente macroscópica. Se establece así un nuevo orden molecular que corresponde básicamente a una fluctuación gigante, estabilizada por intercambios de energía con el mundo externo.»

Fragmento (adaptación). Ilya Prigogine: ¿Tan sólo una ilusión?. Una exploración del caos al orden. Tusquets Editores. Ha aparecido aquí con anterioridad.

«La materia, ciega en el equilibrio, manifiesta potencialidades imposibles en otras condiciones alejadas del mismo.»

Fragmento, Leyes del caos, vida e inteligencia.

Imagen: Emergence, por Sayaka Ganz. Visto en adafruit industries.

El sistema judicial, amoral, es tan sólo un factor de selección natural

«Con el tiempo, la posibilidad de relacionar los patrones de actividad mental —detectados mediante resonancia magnética funcional— con ciertos estados mentales podría dar la vuelta a las directrices para decidir si un acusado “controlaba” sus acciones o para determinar su pena. Nadie sabe aún en qué derivarán estos cambios; pero el sistema judicial, la opinión pública y los neurocientíficos necesitan entender lo que está en juego para seguir garantizando una sociedad “justa”, por más que este tipo de cuestiones sacudan algunas de las ideas tradicionales sobre la naturaleza humana […]

¿No sufrirían las nociones de libre albedrío y de responsabilidad personal un enorme desgaste si todo comportamiento antisocial pudiera explicarse en términos neurológicos

Michael S. Gazzaniga: La neurociencia en el sistema judicial. Investigación y Ciencia, junio de 2011.

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«El determinismo que se desprende de teorías científicas puede desembocar en atrocidades sociales.

Para asegurarse que la determinación genética no diera lugar a calamidad alguna. La UNESCO constituyó en 1993 el Comité Internacional de Bioética, presidida por Nöelle Lenoir. Tras cuatro años de deliberación, presentaron el borrador de La Declaración Universal del Genoma Humano y los Derechos Humanos.

Allí se explicita: “nadie será sometido a discriminación basada en características genéticas que tengan por finalidad infringir o tener el efecto de infringir los derechos humanos, las libertades fundamentales y la libertad humana”.»

Fragmento, ¿darwin o lamarck?.

«Se denomina darwinismo social a la creencia de que la evolución social puede ser explicada por medio de leyes de la evolución biológica. Ha sido definido -en un sentido amplio- como “aquella teoría que afirma que las leyes sociales forman parte de las leyes naturales, y que pone en primer plano la lucha entre individuos o grupos humanos como fuente de progreso social y biológico”. […]

La utilización de leyes naturales como justificación de opciones morales o sociales constituye el centro ético del proyecto, en el sentido de que su busca de basar proyectos socio políticos “en leyes científicas” busca evitar la responsabilidad personal por tales decisiones».

Fragmentos, Darwinismo social, Wikipedia. Hay multitud de ideas interesantes en ése texto.

Por supuesto, la evolución no es progreso —entendido como mejora atemporal—. La evolución persigue las condiciones ambientales. «La misma orientación a una determinada dirección no implica una ventaja evolutiva atemporal. Las condiciones ambientales y culturales cambian con el tiempo».

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Fuente de la primera imagen: Wikipedia. Su inclusión aquí pretende hacer referencia a cómo el sistema judicial no es más que una condición de contorno “de alto nivel” —esto es, que su existencia no se “justifica por sí misma” sino que es el resultado de la interrelación de los complejos mecanismos biológicos existentes en estratos más profundos, al nivel del individuo— para la evolución de las sociedades. No obstante, pocas cosas, o ninguna, hay en este mundo que “se justifiquen por sí mismas”. En su lugar su existencia se debe a una extensa red de interdependencia y coherencia con el resto del universo, y la necesidad de su existencia como entidades aisladas no debería parecer obvia.

Fuente de la segunda imagen.

Producción en cadena

«Hablar de ciertas instituciones del gobierno y del establishment como “el sistema” es hablar correctamente. Son organizaciones sustentadas por relaciones estructurales [bueno, como todo, pero se entiende] incluso cuando han perdido todo otro significado y propósito. La gente llega a la fábrica y efectúa una tarea totalmente carente de significado [desde “el punto de vista humano”, al menos] desde las ocho hasta las cinco, sin preguntar por qué exige la estructura que las cosas sean así. No hay en ello un villano, no hay “el malo” deseoso de que ellos vivan estas existencias sin significado; se trata, tan sólo, de que el sistema lo exige y nadie quiere asumir la formidable misión de cambiar la estructura sólo porque carece de significado. […]

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Pero arrasar una fábrica, rebelarse contra un gobierno o abstenerse de reparar una moto, es atacar a los efectos más bien que a las causas, y mientras el ataque se realice tan sólo contra los efectos, ningún cambio es posible. El verdadero sistema, el real sistema, es nuestra actual construcción de la propia racionalidad, y, si una fábrica es destruida, pero se deja en pie la racionalidad que ella producía, entonces esta racionalidad producirá, simplemente, otra fábrica. Si una revolución destruye un gobierno, pero las pautas de pensamiento que producía ese gobierno se dejan intactas, entonces tales pautas se repetirán en el gobierno subsiguiente. Se habla tanto del sistema y se le comprende tan poco…»

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Imagen superior: In the mid-1920s, these women were the equivalent of today’s circuit board builders. Called “coil winders,” they worked winding transformer coils for radios in a Philadelphia factory. This image gives us a glimpse of old-school tech at the moment when it was most cutting edge.

Imagen inferior: Rosalind Franklin, British biophysicist whose X-ray crystallography image was used to deduce the double-helix structure of DNA. Franklin’s image was shown, without consent, to James Watson. En Today in History: Rosalind Franklin and the Discovery of DNA: «However, when the three scientists [Watson, Crick y Wilkins] accepted their Nobel Prize in 1962 there was no mention of Franklin’s contribution».

El texto es un fragmento de Zen y el arte del mantenimiento de la motocicleta. Una indagación sobre los valores, aunque los enlaces son marca de la casa.